（三）联合采样监测。由我部组织跨省界流域相邻两省环保部门共同制定跨省界水质监测方案，明确采样断面与时间、监测指标与方法，定期开展联合监测。敏感时期增加监测频次，环保部门要组织水利、渔政等部门及时通报监测数据等情况。一旦发生跨省界水污染事故，相邻环保部门立即启动环境突发事件应急监测预案，在规定时间内到达同一断面共同采样监测，一方无故不到或不按规定监测的以另一方监测数据为准。双方对监测数据提出异议时，应保存水样，由中国环境监测总站负责监测。
（四）联合执法监督。在定期会晤、信息共享和联合监测的基础上，跨省界流域相邻环保部门要定期或不定期地组成联合检查组，共同对两地水污染防治情况开展现场检查，加强流域重点水污染源、城镇污水处理厂等环保措施落实情况的督查，预防跨界水污染事故的发生。同时要互相通报在联合检查中发现问题的整改情况。环境保护部区域环境保护督查中心要加强跨省界流域交界地区的环境监管和督查。
（五）敏感时期预警。在敏感时段（如枯水期、汛期）和河流敏感区域（如饮用水源地），跨省界流域相邻环保部门要及时了解重点污染源排污变化情况，必要时采取限产限排等控制排污总量的措施。加强与水利、渔政等部门的协调与沟通，及时了解江河流量、闸坝调控、污水处理厂运行等情况，在确保跨省界断面水质未明显下降的前提下，实施小流量排放等措施，保障水环境安全。
（六）协同应急处置。一旦发生跨省界水污染突发事件，交界地区环保部门要立即报请当地政府迅速启动环境突发事件应急预案，提出控制、消除污染的具体应急措施，协助当地政府控制和处置水污染。并按有关程序及时上报情况。
（七）协调处理纠纷。跨省界水污染纠纷发生后，应依法由相邻两省人民政府共同协商处理。经协商确实无法达成共识的，相邻两省人民政府提出申请，由我部进行协调。经协调并达成共识时，按协调意见落实。经协调仍无法达成一致意见时，由我部提出处理意见上报国务院批准，并按国务院批复意见执行。
（八）开展后督查工作。对于引发跨省界水污染纠纷的企事业单位，当地政府和环保部门要依法处罚并提出限期整改要求，由相邻两省环保部门组成联合督查组对其整改情况开展后督查，确保整改措施落实到位。必要时，由我部组织进行督查、督办。
·商务部、环境保护部公告2008年第42号－－2008年度部分消耗臭氧层物质(ODS)进出口配额总量的公告
·中华人民共和国城乡建设环境保护部关于外国人私有房屋管理的若干决定[失效]
·环境保护部、中央宣传部、教育部关于做好新形势下环境宣传教育工作的意见
·环境保护部公告2009年第27号――关于环境影响评价工程师职业资格注销登记事项的公告
·环境保护部公告2009年第26号－－关于发布2009年第二批环境污染治理设施运营资质获证单位及变更单位名单的公告
·环境保护部办公厅关于印发《应对甲型H1N1流感疫情医疗废物管理预案》的通知
·环境保护部公告2009年第25号－－关于发布达到国家机动车排放标准的新生产机动车型和发动机型的公告
·最高人民法院、城乡建设环境保护部《关于复查历史案件中处理私人房产有关事项的通知》
·环境保护部科技标准司关于发布“十一五”国家科技支撑计划重点项目“新农村建设城乡环保统筹技术与对策研究”课题申请指南的通知
·环境保护部公告公告2009年第24号――各单位批准的评价范围及变更后的机构名称等情况等
·环境保护部办公厅关于印发《环境监测质量管理三年行动计划(2009－2011年)》的通知
·环境保护部、财政部关于印发《中央农村环境保护专项资金环境综合整治项目管理暂行办法》的通知
·最高人民法院、公安部、商业部、城乡建设环境保护部关于转发陕西省西安市《关于办理离婚、房产案件中有关户粮分立、迁转和房产变动问题的联合通知》的通知
·财政部、环境保护部关于印发《中央农村环境保护专项资金管理暂行办法》的通知